功能性食品原料一般分為常規食品和改良食品兩類。
傳統食品都是天然的，富含維生素、礦物質、抗氧化劑和有益心臟健康的脂肪等重要營養成分的天然食品。與此同時，轉基因食品添加了額外的成分，如維生素、礦物質、益生菌或纖維，以增加食物的健康益處。
以下是一些傳統功能性食品原料的例子:
水果:漿果，獼猴桃，梨，桃子，蘋果，橙子，香蕉
蔬菜:西蘭花、花椰菜、羽衣甘藍、菠菜、西葫蘆
堅果:杏仁、腰果、開心果、澳洲堅果、巴西堅果
種子:奇亞籽、亞麻籽、大麻籽、南瓜籽
豆類:黑豆，鷹嘴豆，海軍豆，扁豆
全谷物:燕麥、大麥、蕎麥、糙米、粗麥粉
海鮮:鮭魚、沙丁魚、鳳尾魚、鯖魚、鱈魚
發酵食品:豆豉，紅茶菌，泡菜，開菲爾，酸菜
香草和香料:姜黃，肉桂，姜，辣椒粉
飲料:咖啡、綠茶、紅茶
這里有一些改良功能性食品的例子:
果汁，強化乳制品，如牛奶和酸奶
牛奶的替代品，如杏仁，大米，椰子，和腰果奶
谷物，如面包和面食
谷物和燕麥
雞蛋
營養豐富的食物，如水果、蔬菜和豆類，以及強化食品，如果汁、雞蛋和谷物，通常被認為是功能性食品原料。
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