目前市面上常見的膠原蛋白主要提取來源主要是:牛豬膠原蛋白，雞骨膠原蛋白和魚膠原蛋白。
而魚膠原蛋白又根據原料部位和生長水域分為:淡水魚皮膠原蛋白、淡水魚魚骨膠原蛋白、深海魚皮膠原蛋白和深海魚鱗/魚骨膠原蛋白。雖然統稱為膠原蛋白，但是品質和價格差異很大。
牛豬膠原蛋白:是以豬、牛等動物的骨、皮等為原料提取。其產量高、價格低。但是豬原蛋白中脂肪含量高，長期服用易發胖，同的牛、豬殖環境不可控，喂食的飼料等易含激素，更有瘋牛病，口蹄疫等病毒風險，相對來說原料安全性較低。
魚膠原蛋白:是以魚骨、魚鱗或魚皮為原料提取，其中魚皮膠原蛋白對皮膚最好，它屬于I型膠原蛋白，氨基酸組成與人體膠原蛋白最為接近，具有高濃度的甘氨酸，羥脯氨酸和脯氨酸。當攝入魚皮膠原時，羥脯氨酸是不會被完全消化分解力游離高氨基酸，而是直接進入血液，刺激細胞活化，促進膠原蛋白合成。同時分子量遠遠小于牛豬膠原，可以直接被小腸壁吸收進入血液，所以生物利用度(吸收率)更高，是其他膠原的約15倍。
另外，現在海洋生態污染嚴重，所以生態湖庫的淡水魚比深海魚更安全，湖庫生態修復工程讓魚生長環境更干凈，沒有水質污染，更不會有激素影響。魚皮膠原蛋白因其生態修復技術要求高，提取過程更復雜，所以成本及售價略高，適合對健康要求更高的愛美人士。
