為了從植物中分離生物堿，首先用石油醚（或己烷、科爾曼等）提取干燥的粉末狀植物提取物。這會去除脂肪、油、萜烯、蠟等。這種提取物被丟棄。現在對該材料進行醇提取，例如用甲醇或乙醇。蒸發提取物留下粗制生物堿混合物。
該植物提取物在稀釋的水溶液之間分配。酒石酸溶液和乙酸乙酯。可以使用檸檬酸等其他酸，也可以用其他溶劑代替。乙酸乙酯層含有中性和弱堿性生物堿。蒸發溶劑以隔離它們。
水。層用NH 3 或Na 2 CO 3 中和并再次用乙酸乙酯萃取。有機層現在含有堿性生物堿，而 aq。層含有季銨離子。
許多生物堿可以通過色譜法直接從酒精提取物中分離出來。這是一種非常適合托烷生物堿（阿托品、可卡因、東莨菪堿）的分離方法。
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